Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

Енот месяц питался картоном и сумел выжить... Енот - необыкновенный зверь. Очередным доказательством этого стало событие, которое произошло на корабле. Обыкновенный енот спокойно пробрался в г...
К 2025 году Голландия забудет о бензиновых двигате... В парламент Нидерландов внесено законодательное предложение, согласно которому через 9 лет с автомобильного рынка страны полностью уйдут машины, р...
Астрофизики слушают звуки древнейших звезд Млечног... Используя метод, известный как астросейсмология, астрофизики британского Бирмингемского университета обнаружили резонансные акустические колебания...
Канадские астрофизики вычислили массу Млечного Пут... Канадские астрофизики опубликовали доклад, в котором они объявили вычисленную ими массу Млечного Пути. Сюда вошла как видимая часть галактики, так...

Читайте также:  Протезы для хождения могут заменить инвалидные коляски

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *