Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

К Земле приближаются две кометы... Как сообщает NASA, 21 и 22 марта к Земле на чрезвычайно близкое расстояние приблизятся два космических тела – кометы-близнецы 52P/LINEAR (в длину ...
Как правильно высадить помидоры в открытый грунт... Следует помнить, что нужно отнестись к данному процессу с полной ответственностью. Не забывайте, что посадка помидоров зависит от конкретных погод...
Белок криптохром может играть роль птичьего компас... Международная группа ученых из Европы и России исследовала возможность птиц различать магнитное поле Земли. Ранее существовала гипотеза, согласно ...
Пять самых опасных цветков в мире... Большинство людей ассоциирует цветы с чем-то светлым, прекрасным и успокаивающим. Действительно, в мире существует огромное количество великолепны...

Читайте также:  Китай использует роговицы глаз свиней для людей

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *