Российские учёные изобрели новый алгоритм для сравнения геномов

genom

Статья коллаборации российских ученых из Университета ИТМО, МФТИ и ФНКЦ ДГОИ, посвященная новому методу обработки метагеномов, была опубликована в журнале Bioinformatics. Как известно, геном — это совокупность генов одного организма, тогда как метагеном — совокупность генов организмов, живущих в одной и той же среде.

Разумеется, различные методики сравнения геномов существуют уже очень давно, однако, разработка отечественных учёных, именуемая MetaFast, на порядок опережает по скорости все существующие алгоритмы. Скорость обработки данных этим способом поражает: более одного миллиарда метагеномов было сравнено менее, чем за 36 часов!

Перспективы использования данной методики практически безграничны. В медицине она позволит выявлять не только различные болезни кишечника, кожи и других органов, заселенных микроорганизмами, но и предрасположенности к ним! Достаточно будет сравнить метагеном кишечника пациента с кишечником здорового человека, чтобы сразу диагностировать такие заболевания, как диабет, цирроз, а также гастроэнтерит. Польза для экологии будет заключаться в сравнении метагеномов двух биомов, с целью определения их состояния и предсказания путей развития. В антропологии же станет возможно быстрое сравнение двух людских популяций. Особенно интересные данные должны появиться при сравнении двух изолированных популяций, сохранивших традиционный уклад.

Рейтинг:
[всего голосов: 2, средний: 5]

Рекомендуем почитать

Факты о Стоунхендже и египетских пирамидах... Кто мы, откуда, куда идем? Кто не знает своего прошлого, у того нет будущего. И все, что после нас остается – это память. Давайте же ее разворошим...
Обезьяны делают орудия труда... В издании Nature опубликована работа британских и бразильских ученых, которые наблюдали за чернополосыми капуцинами. Выяснилось, что они не только...
Арктическая тундра Северной Америки активно зелене... Арктические территории Северной Америки меняют свою «окраску». Там, где ранее была замёрзшая тундра, ныне зеленеют и цветут растения. Учёные выясн...
Шимпанзе играют в куклы Ученые обнаружили в Африке группу шимпанзе, играющих в куклы, причем в качестве кукол животные использовали обыкновенные ветки деревьев и небольши...

ПРОЕКТУ НУЖНА ВАША ПОМОЩЬ!

Комментарии:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *